产品介绍

荧光定量PCR(qPCR)一种实时监控核酸扩增的技术——在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的变化动态监测整个反应过程,。主要用于基因表达分析和病原体检测。


应用领域

   1、基础分子生物学研究    2、临床医学诊断与研究    3、药物研发与疗效评价    4、农业与植物科学研究    5、食品安全与环境监测    6、中医药研究领域
 

技术原理

分析内容

第一阶段:数据获取与质控 这是确保后续分析可信的基础。

1、检查扩增曲线和熔解曲线
    扩增曲线:确认所有目的基因和内参基因的曲线呈现标准的“S”形,平台期平稳。排除异常曲线(如起跳过早、平台期骤降、形状怪异),这可能提示污染、抑制剂或引物二聚体。
    熔解曲线:确认每个反应只有一个尖锐的单一峰。出现双峰或宽峰可能提示非特异性扩增、引物二聚体或基因组DNA污染。

2、 评估扩增效率
    斜率:理想斜率为 -3.32(对应100%效率)。通常可接受范围为 -3.1 ~ -3.6(效率90%~110%)。
    R²值:反映标准曲线的线性度,应 > 0.99。
    效率:计算公式为 Efficiency = [10^(-1/斜率) - 1] * 100%。

3、 确定阈值线(Threshold)和Ct值
    阈值线:通常由仪器软件自动设置在扩增曲线指数期的早期阶段,所有反应基线噪声之上。同一组实验中所有基因的分析必须使用统一的阈值线。
    Ct值:每个反应孔扩增曲线与阈值线相交时所对应的循环数。记录所有样品目的基因和内参基因的Ct值。

第二阶段:相对定量分析(最常用)

以研究基因表达差异为例,常用 ΔΔCt法。
1、内参基因均一化
    目的:消除样品间加样量、RNA质量、反转录效率等非生物学差异。
    计算:对于每个样品,计算 ΔCt = Ct(目的基因) - Ct(内参基因)。
    注意:内参基因必须经过验证,其表达在处理组和对照组间稳定。

2、对照组校准
    目的:将处理组(实验组)的表达量相对于对照组(如未处理组、0时刻组)进行标准化。
    计算:选择对照组ΔCt的平均值作为 校准因子。 对于每个样品(包括对照组自身),计算 ΔΔCt = ΔCt(样品) - ΔCt(对照组均值)。

3、 计算相对表达量(Fold Change)
    公式:相对表达量 = 2^(-ΔΔCt)
    解读: 结果 = 1:表示表达无变化。 结果 > 1:表示表达上调(例如,2.5表示上调1.5倍)。 结果 < 1:表示表达下调(例如,0.4表示下调至对照组的40%,即下调了1.5倍,常表示为 -1.5倍)。

第三阶段:统计分析

1、生物学重复和技术重复
    生物学重复:来自不同个体或独立培养的样品,反映生物学变异,必须进行。通常至少需要3次。
    技术重复:同一样品在同一板上的重复加样,反映操作和仪器变异,建议进行(通常2-3次)。
    数据处理:先对技术重复取平均值或中位数,得到每个生物学重复的最终Ct值或表达量。

2、 统计检验
    将处理组的相对表达量(2^(-ΔΔCt)值)与对照组的“1”进行比较。
    常用方法: 两组比较:Student‘s t检验(数据符合正态分布)或Mann-Whitney U检验(非参数)。
                      多组比较:单因素方差分析,若显著则进行事后检验(如Tukey, Dunnett‘s)。
    结果呈现:通常以“平均值 ± 标准差(SD)或标准误(SEM)”的形式展示,并在图表中用星号(*)标注显著性水平(如 *p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001)。



研究结果

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